Nature重磅!浙大郭国骥团队绘制世界首个人类细胞图谱

2020-03-26浙江大学科研青塔

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摘要:近日,世界首个人类细胞图谱在浙大绘制成功。 北京时间2020年3月26日,浙江大学医学院郭国骥教授团队的这项研究成果在线发表于《自然》。而在两年前,该研究团队在《细胞》上发表了世界首个小鼠细胞图谱。

近日,世界首个人类细胞图谱在浙大绘制成功。

北京时间2020年3月26日,浙江大学医学院郭国骥教授团队的这项研究成果在线发表于《自然》。而在两年前,该研究团队在《细胞》上发表了世界首个小鼠细胞图谱。

“这项工作概括地说就是人体细胞数字化。”郭国骥表示,“我们能用数字矩阵描述每一个细胞的特征,并对它们进行系统性的分类。发现了一些特殊的表达模式,并定义了30多种新细胞种类。”

郭国骥介绍,该成果主要是源于团队及合作者30多人近两年来夜以继日的奋斗。

郭国骥(前排)与团队成员

该论文建立了人类细胞图谱的基本框架;发现成人非免疫细胞的广泛免疫激活;提出体内干细胞和祖细胞的分化过程是一个细胞基因表达从混乱到有序的过程;并认为基因组中的调节子预先决定了分化终端的稳定状态。

谈及谱图对医学的临床应用,郭国骥告诉《中国科学报》记者,“我们现在建立的是正常细胞的单细胞转录组的数据库,可以用于再生医学种子细胞的鉴定。未来如推广到疾病细胞图谱,便有可能的运用到疾病的单细胞水平诊断上。细胞图谱的数据对于理解疾病的发生会有重要的意义,但临床治疗方面的应用尚需要更多的积累。”

团队对60种人体组织样品和7种细胞培养样品进行了Microwell-seq高通量单细胞测序分析,系统性地绘制了跨越胚胎和成年两个时期、涵盖八大系统的人类细胞图谱。

一张单细胞水平的人类细胞图谱

通过这张图谱,团队发现,多种成人的上皮、内皮和基质细胞在组织中似乎扮演着免疫细胞的角色。

此外,通过跨时期、跨组织和跨物种的细胞图谱分析,团队揭示了一个普适性的哺乳动物细胞命运决定机制:干细胞和祖细胞的转录状态混杂且随机,而分化和成熟细胞的转录状态就变得分明且稳定,也就是说,细胞分化经历了一个从混乱到有序的发展过程。

该研究首次从单细胞水平上全面分析了胚胎和成年时期的人体细胞种类,研究数据将成为探索细胞命运决定机制的资源宝库,研究方法将对人体正常与疾病细胞状态的鉴定带来深远影响。

郭国骥团队运用自主研发的Microwell-seq高通量单细胞分析平台,建立了70多万个单细胞的转录组数据库,鉴定了人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类。

同时,团队开发了scHCL单细胞比对系统用于人体细胞类型的识别,并搭建了人类细胞蓝图网站。

郭国骥说:“我们的工作在测序深度和细胞数目上都存在局限性,但是在跨组织和跨物种的数据可比性上有较大优势。完美版的人类细胞图谱还应该整合空间信息、多组学数据和人群分析,这需要全世界科学家的共同努力。”

团队成员

论文信息:DOI:10.1038/s41586-020-2157-4

本文转载自:浙江大学。文章为作者独立观点,不代表青塔立场,转载请联系原作者。

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